Final
Parma3–0
MarseilleSemifinales (2 cruces)
Marseille0–0
BolognaIda
Bologna1–1MarseilleVuelta · pasó Marseille Se definió por sorteo.
Atlético de Madrid1–3ParmaIda
Parma2–1Atlético de MadridVuelta · Global 5-2: pasó Parma
Cuartos de final (3 cruces)
Atlético de Madrid2–1
RomaIda
Roma1–2Atlético de MadridVuelta · Global 4-2: pasó Atlético de Madrid
Bologna3–0
LyonIda
Lyon2–0BolognaVuelta · Global 3-2: pasó Bologna
Bordeaux2–1ParmaIda
Parma6–0BordeauxVuelta · Global 7-2: pasó Parma
Tercera ronda (3 cruces)
Roma1–0
ZürichIda
Zürich2–2RomaVuelta · Global 3-2: pasó Roma
Bologna4–1
Real BetisIda
Real Betis1–0BolognaVuelta · Global 4-2: pasó Bologna
Rangers1–1ParmaIda
Parma3–1RangersVuelta · Global 4-2: pasó Parma
Segunda ronda (4 cruces)
Roma1–0
LeedsIda
Leeds0–0RomaVuelta · Global 1-0: pasó Roma
Grasshoppers0–2
FiorentinaIda
Fiorentina0–3GrasshoppersVuelta · con alargue · Global 3-2: pasó Grasshoppers
Bologna2–1
Slavia PrahaIda
Slavia Praha0–2BolognaVuelta · Global 4-1: pasó Bologna
Wisła Kraków1–1ParmaIda
Parma2–1Wisła KrakówVuelta · Global 3-2: pasó Parma
Primera ronda (5 cruces)
Silkeborg0–2RomaIda
Roma1–0SilkeborgVuelta · Global 3-0: pasó Roma
Udinese1–1
LeverkusenIda
Leverkusen1–0UdineseVuelta · Global 2-1: pasó Leverkusen
Fiorentina2–1
Hajduk SplitIda
Hajduk Split0–0FiorentinaVuelta · Global 2-1: pasó Fiorentina
Sporting CP0–2BolognaIda
Bologna2–1Sporting CPVuelta · Global 4-1: pasó Bologna
Fenerbahçe1–0ParmaIda
Parma3–1FenerbahçeVuelta · Global 3-2: pasó Parma
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Los 35 resultados están confirmados por al menos dos fuentes (RSSSF, UEFA). Están solo los partidos de clubes italianos. Los resultados son los del final del partido (con alargue si lo hubo); en los historiales, los definidos por penales cuentan como empate.
Fuentes: UEFA · RSSSF 1998/99