Cuartos de final
Marseille1–0
InterIda
Inter0–1MarseilleVuelta · Global 2-0: pasó Marseille
Cuarta ronda (2 cruces)
Villarreal2–0
RomaIda
Roma2–1VillarrealVuelta · Global 3-2: pasó Villarreal
Benfica0–0InterIda
Inter4–3BenficaVuelta · Global 4-3: pasó Inter
Tercera ronda (4 cruces)
Gaziantepspor1–0RomaIda
Roma2–0GaziantepsporVuelta · Global 2-1: pasó Roma
Sochaux2–2InterIda
Inter0–0SochauxVuelta · pasó Inter Se definió por sorteo.
Parma0–1
GençlerbirliğiIda
Gençlerbirliği3–0ParmaVuelta · Global 4-0: pasó Gençlerbirliği
Perugia0–0
PSVIda
PSV3–1PerugiaVuelta · Global 3-1: pasó PSV
Segunda ronda (3 cruces)
Roma1–0
Hajduk SplitIda
Hajduk Split1–1RomaVuelta · Global 2-1: pasó Roma
Salzburg0–4ParmaIda
Parma5–0SalzburgVuelta · Global 9-0: pasó Parma
Perugia2–0
Aris T.Ida
Aris T.1–1PerugiaVuelta · Global 3-1: pasó Perugia
Primera ronda (4 cruces)
Roma4–0
VardarIda
Vardar1–1RomaVuelta · Global 5-1: pasó Roma
Salzburg0–1
UdineseIda
Udinese1–2SalzburgVuelta · Global 2-2 (goles de visitante): pasó Salzburg
Metalurh Donetsk1–1ParmaIda
Parma3–0Metalurh DonetskVuelta · Global 4-1: pasó Parma
Dundee1–2PerugiaIda
Perugia1–0DundeeVuelta · Global 3-1: pasó Perugia
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Los 28 resultados están confirmados por al menos dos fuentes (RSSSF, UEFA). Están solo los partidos de clubes italianos. Los resultados son los del final del partido (con alargue si lo hubo); en los historiales, los definidos por penales cuentan como empate.
Fuentes: UEFA · RSSSF 2003/04